Terkait dengan pembatalan UN 2020, Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan dalam Surat Edaran tentang Pelaksanaan Kebijakan Pendidikan Dalam Masa Darurat Penyebaran Covid-19 mengatur penerimaan murid baru sebagai berikut:
- Penerimaan Peserta Didik Baru (PPDB) pada jalur prestasi dilaksanakan berdasarkan akumulasi nilai rapor lima semester terakhir dan/atau
- Berdasarkan prestasi akademik/non-akademik di luar rapor sekolah
MAN 2 Pangandaran untuk tahun ajaran 2020/2021 kembali membuka penerimaan Peserta Didik Baru (PPDB). Mulai tahun 2020 PPDB di MAN 2 Pangandaran bisa dilakukan secara online sehingga memudahkan orang tua siswa untuk mendaftarkan anaknya di MAN 2 Pangandaran.